INTRO




ENTWICKLUNG




SOFTWARE




PROJEKT




DOWNLOAD




NATUR




KLASSIKER
[Map of Belief]




OPENBRAIN




KONTAKT




LINKS








Projekt Openbrain


     
Openbrain Screenshots

Openbrain ist eine 3D-Visualisierung der menschlichen Gehirn-Anatomie. Für Designer neuronaler Strukturen ist die organische Gehirn-Anatomie der neuronalen Informationsverarbeitung von großem Interesse. Die komplexen hierachischen Verarbeitungsschritte haben auch für kleinere künstliche neurale Netze ihre Gültigkeit. Die Software visualisiert die einzelnen funktionellen Einheiten nach ihrer Hauptfunktion und entsprechend ihrer Klassifizierung. Einzelne Bereiche (z.B. das Kleinhirn) können gezielt ausgeblendet werden, beim Klick auf den Namen in der Liste erscheint ein Informationstext. Alle Objekte liegen in einer Baumliste vor und können ineinander geschachtelt werden. Diese Darstellung ermöglicht die anatomische Hervorhebung aller relevanten Bereiche einer speziellen Funktion, wie z.B. des visuellen Systems.

Die aktuelle Version ist ein konzeptioneller Entwurf und zeigt zunächst schematisch interessante anatomische Bereiche des Gehirns. Die vorliegende Version von Openbrain läuft z.Z. unter Linux und wird in regelmässigen Abständen um detailiertere Strukturen erweitert. Die Objekte wurden von sagitalen Computer-Tomographie-Aufnahmen, die freundlicherweise zur Verfügung gestellt wurden, manuell abgenommen. Die aktuellen Proportionen sind noch nicht proportionsgerecht, z.Z. etwas in die Breite gedehnt. Das Paket enthält die GNU-GCC Quelltexte und das für ein 64Bit-System kompilierte Programm unter Linux auf QT-Basis.

  • Version 1.01 - 19.09.2006
    Windows-Version auf OpenGL-Basis

  • Version 1.00 - 17.07.2006
    Linux-Startversion in reiner Drahtgitter-Ansicht

Features

  • XML-basierte Gehirn-Visualisierung

  • Geschachtelte Objektgruppen, funktionell geordnet

  • Einfache 3D-XML-Tags - erlauben eine simple Drahtgitter-Visualisierung

  • OpenGL

  • Sourcen für Windows und Linux

Geplante Erweiterungen

  • Visuelles System

  • Auditives System

  • Corticale Felder

  • Tiefergehende Thalamusstrukturen

  • Ventrikel

  • Blutgefäße

  • Gedächnisschaltkreise

  • Transmittersysteme

  • ...





Einzelne Objekte - hier das Großhirn - können mit einem Klick ein- und ausgeblendet werden


Tasten-/Mausbelegung

Taste

Funktion

Pfeil-Tasten

Rotation um 2 Achsen

r-Taste

Setzt die Ansicht wieder auf die Anfangssituation

Bild auf/Bild ab-Tasten

Ansicht vergrößern/verkleinern

Mausklick auf ein Listenobjekt

Wechsel zur Textansicht

Mausklick in grünes Feld links oben im Textmodus

Zurück zur 3D-Ansicht

XML-Tags

Tag-Beispiel

Funktion

<object3d>

Beginn einer 3D-XML-Datei

</object3d>

Ende einer 3D-XML-Datei

<rgb> 200 200 255 </rgb>

Setzt die Aktuelle Stiftfarbe in Rot-Grün-Blau-Folge (RGB-hier Hellblau).

<scale> 2.0 </scale>

Skaliert um den angegebenen Faktor (Hier verdoppelt sich die Größe des Objekts)

<line> 0 0 0; 30.1 70.5 50 </line>

Zeichnet eine 3D-Line vom Startpunkt zum Endpunkt in der aktuellen Stiftfarbe

<point> 10.0 11.0 12.0 </point>

Zeichnet einen 3D-Punkt in der aktuellen Stiftfarbe

<circle> 100 200 300 10 </circle>

Zeichnet einen Kreis an die 3D-Koordinaten 100,200,300 mit dem Radius 10

<tri> 1.0 1.0 1.0; 2.0 0.0 0.0: 3.0 2.0 0.0 </tri>

Zeichnet ein Dreieck mit den angegebenen Koordinaten in der aktuellen Stiftfarbe

<koor> 1.0 2.0 3.0;</koor>

Eintragung einer Koordinate. Mit jedem Aufruf wird die Koordinaten-Liste um ein Element erweitert. Mit "index_tri" oder "index_quad" können diese Punkte später zu Objekten verbunden werden.

<index_tri> 1 2 5 </index_tri>

Verbindet die eingetragenen Koordinaten mit den Indexen 1,2 und 5 zu einem Dreieck in der aktuellen Stiftfarbe

<index_quad> 1 2 5 7</index_quad>

Verbindet die eingetragenen Koordinaten-Punkte mit den Indexen 1,2,5 und 7 zu einem Rechteck der aktuellen Stiftfarbe

Literatur

  • Gehirn und Verhalten - Pritzel, Brand, Markowitsch

  • Neurowissenschaften - Kandel, Schwarz, Jessell

Download


Die Windows-Version auf OpenGL-Basis (1.2 MB)
openbrain1.01.zip - 19.09.2006

Die Linux-Basis-Version (Drahtgitter) (1.7 MB)
openbrain1.00.zip - 17.07.2006